中新社北京6月8日電 (記者 孫自法)記者8日從中國(guó)科學(xué)院微生物研究所(中科院微生物所)獲悉，該所劉雙江研究團(tuán)隊(duì)歷時(shí)兩年研究，最新已建成資源豐富的健康人群腸道微生物菌株資源庫(kù)(human gut microbe biobank, hGMB)，為構(gòu)建中華腸道微生物資源庫(kù)奠定了重要基礎(chǔ)。
劉雙江研究員介紹，hGMB包括400個(gè)不同物種，其中102個(gè)物種為首次分離、培養(yǎng)和鑒定，1170株代表性菌株保存在中國(guó)普通微生物菌種保藏中心，已向科研界和產(chǎn)業(yè)界提供數(shù)次菌株服務(wù)，支持腸道微生物功能開(kāi)發(fā)和微生物-宿主互作的研究。為更加充分發(fā)揮和挖掘菌株資源的價(jià)值，hGMB物種信息已在官網(wǎng)公布。
構(gòu)建中華腸道微生物資源庫(kù)具有長(zhǎng)遠(yuǎn)戰(zhàn)略意義和經(jīng)濟(jì)社會(huì)價(jià)值。hGMB構(gòu)建過(guò)程中，研究團(tuán)隊(duì)從239例來(lái)自不同地區(qū)、不同年齡的體檢健康人群的新鮮糞便樣品中挑取超過(guò)2萬(wàn)個(gè)單克隆菌落，擴(kuò)大培養(yǎng)后從中鑒定出超過(guò)1萬(wàn)個(gè)純培養(yǎng)分離株，并對(duì)本次發(fā)現(xiàn)的全部新物種進(jìn)行基因組測(cè)序和分類(lèi)學(xué)描述與命名。
研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)健康人腸道宏基因組分析，發(fā)現(xiàn)菌株資源庫(kù)中的85個(gè)新物種出現(xiàn)在超過(guò)90%健康人腸道中。進(jìn)一步對(duì)全球人腸道相關(guān)數(shù)據(jù)分析表明，hGMB覆蓋79%人腸道已知常見(jiàn)菌屬和75%常見(jiàn)物種；與目前最大的人腸道基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(UHGG)比對(duì)發(fā)現(xiàn)，hGMB貢獻(xiàn)出24個(gè)在腸道免培養(yǎng)組學(xué)研究中未被探測(cè)到卻普遍存在的“暗”物種。
越來(lái)越多的證據(jù)表明，腸道微生物與宿主健康和生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān)，在未來(lái)人體健康管理和醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展中，腸道微生物資源潛力巨大，在揭示宿主表型與腸道菌群因果關(guān)系的研究中，也發(fā)揮至關(guān)重要作用。由中科院微生物所劉雙江、劉暢、杜夢(mèng)璇、熱西丁·阿不都艾尼、于海英等共同完成hGMB構(gòu)建的重要成果論文，近期已在國(guó)際專(zhuān)業(yè)學(xué)術(shù)期刊《微生物組》(Microbiome)發(fā)表。
中科院微生物所稱(chēng)，在成功構(gòu)建hGMB之前，劉雙江團(tuán)隊(duì)2020年還發(fā)表迄今最大的模式動(dòng)物小鼠腸道微生物資源庫(kù)(mGMB)，mGMB包含126種微生物及其基因組，其中77種微生物是首次成功分離培養(yǎng)的新物種，使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48屬76種增至110屬180種，并在此過(guò)程中形成一套厭氧微生物分離培養(yǎng)與物種鑒定描述的最簡(jiǎn)標(biāo)準(zhǔn)化流程。(完) 【編輯:田博群】
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